Добрый день, Роман! За отца молиться в храме не только можно, но и нужно. В Третьей книге Царств (Ветхий Завет), рассказано как царь Соломон при освящении Иерусалимского храма просил, чтобы Господь и не ведующим Его явлен был. За отца нельзя только подавать поминание в Святой Алтарь и вынимать частицы из просфор. Если можно сообщите какой отец веры и исходя из этого я Вам подскажу оптимальный вариант, как за него можно молиться в православном храме. С уважением, о. Аркадий.