Девочку крестить можно однозначно. То, что мать согласна говорит о том, что она скорее всего не убежденная атеистка, а просто по каким-то личным причинам не хочет себя отождествлять с Церковью. Нужно за мать тоже усердно молиться, чтобы Господь ее привел в познание истины. С уважением, о.Аркадий.