Наталья , добрый день!
Армяне григориане тоже христиане. Но у нас с ними нет евхаристического общения. Так сложилось исторически, начало этой истории в V веке. Поэтому вопрос можно ли за них молиться в православных храмах - деликатный и дискуссионный. Тут видно есть некая грань - свечи ставить и молиться в слух о них можно, а поминать на прокомедии не логично. Видимо батюшка именно это имел в виду.
С уважением, отец Аркадий.